选目标是小仓市，但由于8月9日那天小仓市上空乌云密布，斯威尼驾机在市区上空来回飞行
3次，也没能找到合适
投弹时机，只好把目标改为长崎。“胖子”在距离地面1800英尺高度爆炸，爆炸中心紧靠三菱兵工厂北侧，爆炸威力估计相当于2.2万吨TNT。
与广岛不同，长崎原子弹爆炸后没有引起大火；再加上长崎多山地形限制爆炸威力，被毁城区总面积也比广岛小
些。然而，长崎核爆还是造成4万人当场死亡，还有大约4万人受伤。在之后数月内，还有大量长崎市民因为烧伤、辐射病以及其他各类核爆引起伤病而死亡。幸运幸存者包括英国皇家空军第二四二中队三等兵比尔·富兰克林(BillFranklin)。他在1942年被日军俘获，当时正在位于长崎以南、距离市区三四英里处船坞干活。他回忆道：
监工手表显示，时间大约为上午10:50，几名学生把
们注意力引向个遥远物体，在们那片蓝天范围内清晰可见。它似乎悬挂在降落伞上。片刻之后，们都被道刺眼白光所淹没，亮度超过上千个升起太阳。
白光消失后，远处并没有传来响亮爆炸声。实际上，有段时间完全静默，只能听到敲锣声音。与台阶距离有900英尺，中间隔着许多障碍物，比如成堆废弃物、立杆、龙骨墩以及遍地废金属。们群人撒腿就跑，每个人都只想着逃命，生怕沉箱四分五裂，海水奔涌而来把们卷入海底。抬头看到夹在混凝土墙之间那不怎
结实五层墙壁渐渐地膨胀，然后突然炸裂。建筑整个侧面看着像个巨大蜂巢。
在被守卫押送返回战俘营路上，富兰克林遇到群又群惊慌失措平民，他们“挤作团相互踩踏”，只想着逃得越远越好。这时，在长崎上空，“爆炸产生烟尘、气体已经形成朵蘑菇云”，看起来“仿佛把打开雨伞”。富兰克林准确地猜到这是种新型炸弹，心里既感到满足，又如释重负。他写道：
们挨三年半打，现在终于等到报仇雪恨时刻。这算是为们众多死于饥饿和虐待战友报仇。现在，毫无疑问，战争即将结束。
8月10日上午7:33，则广播消息预示着战争即将结束：东京广播电台宣布，日本z.府“遵循天皇陛下（裕仁天皇）实现全面和平圣意”，“愿意接受中、美、英三国1945年7月26日在波茨坦发表宣言中列出条
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